Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm2A2A7B5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm2A2A7B5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms