Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71e1A1L3C1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms