Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trav12-2A0N8N6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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