Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cln8Q9QUK3 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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