Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtaQ9JHK4 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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