Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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Zbed3Q9D0L1 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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Zbed3Q9D0L1 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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Zbed3Q9D0L1 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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Zbed3Q9D0L1 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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