Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sgo1Q9CXH7 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sgo1Q9CXH7 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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Sgo1Q9CXH7 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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Sgo1Q9CXH7 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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Sgo1Q9CXH7 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sgo1Q9CXH7 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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