Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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