Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn16Q925N4 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn16Q925N4 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cldn16Q925N4 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.5 ms