Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp38Q8BW70 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Usp38Q8BW70 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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