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Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1
Chn2, Beta-chimaerin, mouse
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332 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Chn2
Q80XD1
Gm43238-201
ENSMUST00000196463
359 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm43563-201
ENSMUST00000196761
198 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
AC132615.1-201
ENSMUST00000213873
255 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Snora20-201
ENSMUST00000082703
128 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25929-201
ENSMUST00000082784
107 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm24527-201
ENSMUST00000082920
107 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm26495-201
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137 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Scgb1b24-201
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279 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25110-201
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121 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25775-201
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121 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm24795-201
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121 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25171-201
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121 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25882-201
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85 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm22088-201
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117 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm24547-201
ENSMUST00000158649
149 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25952-201
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74 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm22114-201
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BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm27402-201
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120 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm45544-201
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88 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
AC141438.3-201
ENSMUST00000215632
202 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm29818-201
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165 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Mir547-201
ENSMUST00000102051
78 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm23531-201
ENSMUST00000104567
68 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm12647-201
ENSMUST00000118977
265 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm11834-201
ENSMUST00000122257
585 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm14298-201
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237 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm16356-201
ENSMUST00000143300
169 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm23262-201
ENSMUST00000158323
168 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25161-201
ENSMUST00000158913
132 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm16307-201
ENSMUST00000161269
210 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm10772-201
ENSMUST00000167981
255 nt
APPRIS P1
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Mir3108-201
ENSMUST00000175500
79 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
AC129085.1-201
ENSMUST00000225263
165 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
AC115735.2-201
ENSMUST00000227135
351 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
AC122769.2-201
ENSMUST00000227248
302 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm14400-201
ENSMUST00000117234
2135 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Olfr1099-202
ENSMUST00000213456
4867 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm16186-201
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216 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Scarna8-201
ENSMUST00000158333
131 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm23821-201
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106 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm19572-201
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338 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Mir30a-201
ENSMUST00000083471
71 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm26111-201
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106 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
4930522L14Rik-202
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2001 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
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TSL 3
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Zfp969-201
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417 nt
TSL 3
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Zfp965-203
ENSMUST00000109043
417 nt
TSL 5
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm44457-201
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76 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm22421-201
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BASIC
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Chn2
Q80XD1
Gm6358-201
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156 nt
APPRIS ALT2
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm24594-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm22985-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm22887-201
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107 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm23793-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Vmn2r-ps20-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Mir6377-201
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114 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Ranbp2-ps2-201
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370 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm44057-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm3702-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
AC136457.1-201
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm23989-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm14671-201
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25827-201
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107 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm22555-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm23779-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm24549-201
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm25300-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm43976-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm44149-201
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Gm44687-201
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235 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Snord95-201
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68 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Chn2
Q80XD1
Trbv21-201
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290 nt
APPRIS P1
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm42606-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm23640-201
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BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm17172-201
ENSMUST00000171782
190 nt
TSL 3
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm23375-201
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83 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Mir3535-201
ENSMUST00000197651
147 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm25814-201
ENSMUST00000082754
107 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm25982-201
ENSMUST00000157920
101 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm24634-201
ENSMUST00000158672
107 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm26727-201
ENSMUST00000180773
366 nt
APPRIS P1
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm43624-201
ENSMUST00000197368
180 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm45738-201
ENSMUST00000203645
233 nt
TSL 5
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm23404-201
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97 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Snora19-201
ENSMUST00000082962
132 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm25703-201
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151 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm23658-201
ENSMUST00000083233
132 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm14307-201
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291 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm14297-201
ENSMUST00000129110
291 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm16362-201
ENSMUST00000135189
214 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm13625-201
ENSMUST00000149283
480 nt
TSL 5
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm23982-201
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106 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm22466-201
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69 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
AC154282.1-201
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265 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Mir532-201
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96 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Vmn1r-ps125-201
ENSMUST00000117767
290 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm25970-201
ENSMUST00000157165
86 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
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ENSMUST00000177836
94 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm38183-201
ENSMUST00000193189
205 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Chn2
Q80XD1
Gm37763-201
ENSMUST00000193445
120 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
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