Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Sft2d1Q5SSN7 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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