Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Trim71Q1PSW8 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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