Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ptchd1Q14B62 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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