Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Hif3aQ0VBL6 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hif3aQ0VBL6 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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