Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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