Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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RabggtbP53612 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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RabggtbP53612 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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RabggtbP53612 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtbP53612 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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RabggtbP53612 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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