Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RxraP28700 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RxraP28700 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RxraP28700 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RxraP28700 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RxraP28700 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RxraP28700 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RxraP28700 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RxraP28700 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RxraP28700 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RxraP28700 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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