Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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Nedd9O35177 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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Nedd9O35177 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Nedd9O35177 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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