Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MttpO08601 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MttpO08601 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MttpO08601 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MttpO08601 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MttpO08601 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms