Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gm2056J3QQ02 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gm2056J3QQ02 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.59□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm2056J3QQ02 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms