Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TrdnE9Q9K5 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TrdnE9Q9K5 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TrdnE9Q9K5 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms