Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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Zfp558E9Q1J0 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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Zfp558E9Q1J0 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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Zfp558E9Q1J0 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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Zfp558E9Q1J0 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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Zfp558E9Q1J0 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
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Zfp558E9Q1J0 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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Zfp558E9Q1J0 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
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Zfp558E9Q1J0 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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