Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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