Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc6D3YZP9 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc6D3YZP9 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms