Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Hmcn1D3YXG0 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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Hmcn1D3YXG0 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
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Hmcn1D3YXG0 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
Hmcn1D3YXG0 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
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Hmcn1D3YXG0 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
Hmcn1D3YXG0 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Hmcn1D3YXG0 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Hmcn1D3YXG0 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Hmcn1D3YXG0 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
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