Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Trabd2bB1ATG9 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Trabd2bB1ATG9 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms