Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Spocd1B1ASB6 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Spocd1B1ASB6 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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