Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Grik3B1AS29 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Grik3B1AS29 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms