Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cln8Q9QUK3 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms