Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtaQ9JHK4 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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