Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp29Q9ES63 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Usp29Q9ES63 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp29Q9ES63 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp29Q9ES63 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp29Q9ES63 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp29Q9ES63 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Usp29Q9ES63 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms