Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Zbed3Q9D0L1 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zbed3Q9D0L1 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms