Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Rprd1bQ9CSU0 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Rprd1bQ9CSU0 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Rprd1bQ9CSU0 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Rprd1bQ9CSU0 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Rprd1bQ9CSU0 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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