Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprtQ99M80 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprtQ99M80 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms