Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Atg4cQ811C2 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Atg4cQ811C2 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms