Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NipblQ6KCD5 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NipblQ6KCD5 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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