| Hoxa13 | Q62424 | Gm24492-201 | ENSMUST00000083798 | 107 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Vmn1r78-202 | ENSMUST00000228244 | 7931 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23950-201 | ENSMUST00000104026 | 129 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25938-201 | ENSMUST00000104139 | 166 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm6444-201 | ENSMUST00000119611 | 458 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm11644-201 | ENSMUST00000119735 | 150 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm22632-201 | ENSMUST00000178266 | 79 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm42960-201 | ENSMUST00000202160 | 241 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC168056.1-201 | ENSMUST00000225270 | 180 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm37895-201 | ENSMUST00000192448 | 4550 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Traj20-201 | ENSMUST00000103721 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15069-201 | ENSMUST00000117792 | 192 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14502-201 | ENSMUST00000118154 | 113 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15067-201 | ENSMUST00000119534 | 156 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15068-201 | ENSMUST00000119796 | 192 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm45886-201 | ENSMUST00000148141 | 342 nt | TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22803-201 | ENSMUST00000158049 | 283 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm45791-201 | ENSMUST00000212908 | 352 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm6109-201 | ENSMUST00000223297 | 348 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Snora69-201 | ENSMUST00000083708 | 131 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24171-201 | ENSMUST00000104126 | 131 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25371-201 | ENSMUST00000158162 | 101 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23342-201 | ENSMUST00000158958 | 115 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26897-201 | ENSMUST00000180627 | 93 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mir7657-201 | ENSMUST00000196051 | 57 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm10203-201 | ENSMUST00000087348 | 198 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Zfp966-201 | ENSMUST00000108949 | 2939 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Tlr8-202 | ENSMUST00000112170 | 3431 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Snord64-201 | ENSMUST00000104003 | 67 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | mt-Tt-201 | ENSMUST00000082422 | 67 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23095-201 | ENSMUST00000083446 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14917-201 | ENSMUST00000118872 | 2105 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr1442-204 | ENSMUST00000208657 | 3148 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24049-201 | ENSMUST00000102409 | 100 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24475-201 | ENSMUST00000157435 | 143 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm16306-201 | ENSMUST00000160568 | 176 nt | TSL 3 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24333-201 | ENSMUST00000175101 | 84 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC127371.3-201 | ENSMUST00000228129 | 415 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm44177-201 | ENSMUST00000204338 | 2667 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22486-201 | ENSMUST00000116815 | 137 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26091-201 | ENSMUST00000122704 | 82 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15281-201 | ENSMUST00000125181 | 351 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26415-201 | ENSMUST00000157673 | 292 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26084-201 | ENSMUST00000157903 | 104 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25460-201 | ENSMUST00000157954 | 127 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26864-201 | ENSMUST00000181346 | 156 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm27792-201 | ENSMUST00000184031 | 115 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25409-201 | ENSMUST00000083764 | 131 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24030-201 | ENSMUST00000083931 | 164 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | G2e3-203 | ENSMUST00000121521 | 2594 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Tlr8-201 | ENSMUST00000049023 | 3158 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm42855-201 | ENSMUST00000197388 | 253 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm19855-201 | ENSMUST00000210145 | 249 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25796-201 | ENSMUST00000082645 | 163 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |