Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Trim71Q1PSW8 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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