Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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ptchd1Q14B62 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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ptchd1Q14B62 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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ptchd1Q14B62 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ptchd1Q14B62 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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