Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp2Q06649 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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Sh3bp2Q06649 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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Sh3bp2Q06649 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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Sh3bp2Q06649 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp2Q06649 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms