Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Hoxd1Q01822 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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