Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtbP53612 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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