Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rpl28P41105 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rpl28P41105 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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