Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpraP18052 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtpraP18052 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpraP18052 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpraP18052 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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