Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FxnO35943 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FxnO35943 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FxnO35943 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FxnO35943 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FxnO35943 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FxnO35943 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FxnO35943 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms