Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Nedd9O35177 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Nedd9O35177 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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