Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Zfp558E9Q1J0 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Zfp558E9Q1J0 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Zfp558E9Q1J0 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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