Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms