Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms