Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Grik3B1AS29 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Grik3B1AS29 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms